Преображенская церковь ценна и внутренним убранством. Храм украшает огромный иконостас, который сохранился практически в первоначальном виде. Его общая длина составляет 25 метров, а высота – около семи. "Особенность иконостаса в том, что он расположен в необычном помещении. Раньше такие помещения называли "о двадцати стенах". Если в большинстве церквей иконостас расположен по прямой линии, то у нас он стоит "о семи стенах", – объясняет начальник отдела реставрации фондовых коллекций музея Игорь Гашков. Иконостас многие годы хранился в домах Пудожского сектора музея-заповедника "Кижи", и только в 2019 году был возвращен на первоначальное место в церкви.